המרכז הרפואי הרצוג מתמחה בבעיות רפואיות המאפיינות את הגיל השלישי, בשיקום, בהנשמה כרונית, בבריאות הנפש, בפסיכו טראומה ובחקר מדעי המוח. 

המרכז הרפואי הרצוג נוסד ב-1894, יש בו 330 מיטות אשפוז והוא השלישי בגודלו בירושלים. הוא כולל אגף שיקום ומחלות חריפות, אגף בריאות הנפש, אגף הנשמה מהגדולים בארץ הכולל מחלקה לילדים ומתבגרים מונשמים ואגף מחלות ממושכות. בניין האשפוז החדש, שבנייתו נשלמה בימים אלו, יוסיף למרכז הרפואי עוד 270 מיטות. המרכז הרפואי הרצוג הוא מוסד ללא כוונת רווח.

למרכז הרפואי, המסונף לפקולטה לרפואה של האוניברסיטה העברית בירושלים, מרכז קליני לחקר מדעי המוח והוא מפעיל שתי מרפאות חוץ: מרכז קהילתי לבריאות הנפש ומטיב – המרכז הישראלי לטיפול בפסיכוטראומה. המרכז הרפואי הרצוג משמש מרכז לימוד והכשרה לסטודנטים מהפקולטה לרפואה של האוניברסיטה העברית בירושלים ולסטודנטים מתחומי סיעוד, פסיכולוגיה ועבודה סוציאלית.